Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdcbp2Q99JZ0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms