Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Smim11aQ99J19 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Smim11aQ99J19 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Smim11aQ99J19 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Smim11aQ99J19 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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