Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms