Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b5Q923D4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sf3b5Q923D4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b5Q923D4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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