Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx4Q91YJ2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx4Q91YJ2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms