Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn4Q8VCH8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn4Q8VCH8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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