Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcho1Q8K285 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms