Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT0

Aldh4a1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh4a1Q8CHT0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aldh4a1Q8CHT0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Aldh4a1Q8CHT0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aldh4a1Q8CHT0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aldh4a1Q8CHT0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aldh4a1Q8CHT0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aldh4a1Q8CHT0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aldh4a1Q8CHT0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aldh4a1Q8CHT0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Aldh4a1Q8CHT0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh4a1Q8CHT0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh4a1Q8CHT0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh4a1Q8CHT0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh4a1Q8CHT0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh4a1Q8CHT0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh4a1Q8CHT0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh4a1Q8CHT0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh4a1Q8CHT0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh4a1Q8CHT0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms