Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep400Q8CHI8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms