Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ercc8Q8CFD5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ercc8Q8CFD5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ercc8Q8CFD5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ercc8Q8CFD5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ercc8Q8CFD5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ercc8Q8CFD5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ercc8Q8CFD5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ercc8Q8CFD5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ercc8Q8CFD5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ercc8Q8CFD5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ercc8Q8CFD5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ercc8Q8CFD5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ercc8Q8CFD5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc8Q8CFD5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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