Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc63Q8CDV6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc63Q8CDV6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.7 ms