Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CntrobQ8CB62 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms