Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
4930507D05RikQ8C9C9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
4930507D05RikQ8C9C9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms