Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6S9

Cfap54, Cilia- and flagella-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 3,106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap54Q8C6S9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap54Q8C6S9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfap54Q8C6S9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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