Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Prpf18Q8BM39 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prpf18Q8BM39 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Prpf18Q8BM39 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Prpf18Q8BM39 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Prpf18Q8BM39 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Prpf18Q8BM39 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Prpf18Q8BM39 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Prpf18Q8BM39 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf18Q8BM39 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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