Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Clrn3Q8BHH8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Clrn3Q8BHH8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Clrn3Q8BHH8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Clrn3Q8BHH8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Clrn3Q8BHH8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Clrn3Q8BHH8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Clrn3Q8BHH8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Clrn3Q8BHH8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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