Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc172Q810N9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms