Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sestd1Q80UK0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sestd1Q80UK0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms