Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efr3bQ6ZQ18 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Efr3bQ6ZQ18 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Efr3bQ6ZQ18 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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