Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RgmaQ6PCX7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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