Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbtb40Q6PCS8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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