Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx6Q6P8X1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms