Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC061212Q6P8K3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC061212Q6P8K3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms