Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc66Q6NS45 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc66Q6NS45 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc66Q6NS45 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc66Q6NS45 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc66Q6NS45 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc66Q6NS45 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc66Q6NS45 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc66Q6NS45 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc66Q6NS45 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc66Q6NS45 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms