Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CARMIL2Q6F5E8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CARMIL2Q6F5E8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms