Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntn4Q69Z26 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms