Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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PtprrQ62132 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PtprrQ62132 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PtprrQ62132 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PtprrQ62132 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PtprrQ62132 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PtprrQ62132 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PtprrQ62132 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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PtprrQ62132 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PtprrQ62132 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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