Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga6Q61739 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms