Protein–RNA interactions for Protein: Q61475

Cd55, Complement decay-accelerating factor, GPI-anchored, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55Q61475 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd55Q61475 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55Q61475 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55Q61475 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55Q61475 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55Q61475 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55Q61475 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55Q61475 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55Q61475 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55Q61475 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55Q61475 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55Q61475 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55Q61475 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55Q61475 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55Q61475 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd55Q61475 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms