Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms