Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CttnQ60598 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CttnQ60598 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CttnQ60598 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CttnQ60598 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms