Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms