Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Brsk1Q5RJI5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Brsk1Q5RJI5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Brsk1Q5RJI5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Brsk1Q5RJI5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Brsk1Q5RJI5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Brsk1Q5RJI5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Brsk1Q5RJI5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brsk1Q5RJI5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Brsk1Q5RJI5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms