Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gm3558Q5FWC9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gm3558Q5FWC9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gm3558Q5FWC9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gm3558Q5FWC9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm3558Q5FWC9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm3558Q5FWC9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm3558Q5FWC9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm3558Q5FWC9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm3558Q5FWC9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm3558Q5FWC9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm3558Q5FWC9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm3558Q5FWC9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm3558Q5FWC9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm3558Q5FWC9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm3558Q5FWC9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3558Q5FWC9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3558Q5FWC9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3558Q5FWC9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3558Q5FWC9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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