Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Krt35Q497I4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms