Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ankrd53Q3V0J4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ankrd53Q3V0J4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ankrd53Q3V0J4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ankrd53Q3V0J4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ankrd53Q3V0J4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ankrd53Q3V0J4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ankrd53Q3V0J4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ankrd53Q3V0J4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd53Q3V0J4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms