Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hipk4Q3V016 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hipk4Q3V016 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hipk4Q3V016 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hipk4Q3V016 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hipk4Q3V016 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hipk4Q3V016 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hipk4Q3V016 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hipk4Q3V016 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hipk4Q3V016 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hipk4Q3V016 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hipk4Q3V016 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hipk4Q3V016 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hipk4Q3V016 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms