Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox3Q3UT54 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox3Q3UT54 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox3Q3UT54 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox3Q3UT54 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox3Q3UT54 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox3Q3UT54 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox3Q3UT54 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox3Q3UT54 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Obox3Q3UT54 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Obox3Q3UT54 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Obox3Q3UT54 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Obox3Q3UT54 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Obox3Q3UT54 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Obox3Q3UT54 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Obox3Q3UT54 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Obox3Q3UT54 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Obox3Q3UT54 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Obox3Q3UT54 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Obox3Q3UT54 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Obox3Q3UT54 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Obox3Q3UT54 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Obox3Q3UT54 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms