Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrch2Q3UMG5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrch2Q3UMG5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms