Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cobll1Q3UMF0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms