Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp8Q3UD82 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Parp8Q3UD82 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp8Q3UD82 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms