Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms