Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
InipQ3TXT3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms