Protein–RNA interactions for Protein: Q3TFD2

Lpcat1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat1Q3TFD2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat1Q3TFD2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Lpcat1Q3TFD2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Lpcat1Q3TFD2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat1Q3TFD2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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