Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cntn3Q07409 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cntn3Q07409 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms