Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccl7Q03366 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms