Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RptnP97347 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RptnP97347 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RptnP97347 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RptnP97347 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RptnP97347 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RptnP97347 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RptnP97347 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RptnP97347 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RptnP97347 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RptnP97347 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RptnP97347 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RptnP97347 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RptnP97347 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RptnP97347 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RptnP97347 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RptnP97347 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms