Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H3f3aP84244 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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