Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ElocP83940 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElocP83940 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElocP83940 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ElocP83940 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElocP83940 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElocP83940 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElocP83940 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElocP83940 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElocP83940 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ElocP83940 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElocP83940 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElocP83940 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElocP83940 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElocP83940 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElocP83940 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElocP83940 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElocP83940 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElocP83940 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElocP83940 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ElocP83940 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElocP83940 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElocP83940 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElocP83940 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElocP83940 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ElocP83940 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElocP83940 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElocP83940 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ElocP83940 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElocP83940 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElocP83940 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ElocP83940 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElocP83940 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElocP83940 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElocP83940 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElocP83940 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElocP83940 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ElocP83940 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElocP83940 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElocP83940 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElocP83940 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElocP83940 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ElocP83940 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElocP83940 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElocP83940 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElocP83940 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElocP83940 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElocP83940 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElocP83940 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElocP83940 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElocP83940 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ElocP83940 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ElocP83940 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElocP83940 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElocP83940 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElocP83940 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElocP83940 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElocP83940 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElocP83940 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElocP83940 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElocP83940 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ElocP83940 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElocP83940 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElocP83940 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElocP83940 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElocP83940 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ElocP83940 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElocP83940 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ElocP83940 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElocP83940 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElocP83940 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElocP83940 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ElocP83940 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ElocP83940 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms