Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NficP70255 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NficP70255 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NficP70255 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NficP70255 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NficP70255 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NficP70255 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NficP70255 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NficP70255 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NficP70255 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NficP70255 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NficP70255 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NficP70255 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NficP70255 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NficP70255 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NficP70255 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NficP70255 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NficP70255 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NficP70255 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NficP70255 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NficP70255 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NficP70255 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms